作用する可能性のある化合物と予測されたグリチルリチン4)を選択し,26-DanとOmicron変異体(BA.5)のRB結合に対する阻害能を検証した.Figure 3C に示すように,100 nMのRBDに対する26-DanのFP値は,グリチルリチンの濃度依存的に減少し,グリチルリチンが26-DanへのRBD結合を阻害していることが示され,グリチルリチンの50%結合阻害濃度(IC50)が0.44 nMであることが示された(R2 = 0.99).Figure 3. (A) The fluorescence polarization curve of 26-Dan upon titration of RBD derived from Delta (B.1.617.2) and Omicron (BA.5) variants. (B) The fluorescence polarization curve in a saliva model. Titration of RBD derived from the Delta variant (B.1.617.2) in PBS and the saliva model including 0.5 g/Lα-amylase, 7 mg/L lysozyme, 8 mg/L acid phosphatase, and 2.7 g/L mucin. (C) The competitive inhibition assay with a model inhibitor glycyrrhizin. [26-Dan] = 2.5 μM and [RBD of Omicron (BA.5)] = 100 nM. The data were shown as mean ± SEM (n = 3) and fitted with the four-parameter logistic equation.そこで,我々の研究室が有する3D骨格分子ライブラリー5-7)の中からヘリックス模倣型100化合物を選び,スクリーニングを行った.その結果,三置換のカルボラン化合物CRL26-1140が見出された8).しかし,Figure 4に示すように,26-DanとOmicron変異体(BA.5)のRB結合に対するCRL26-1140の阻害能は,グリチルリチンに比べるとその阻害活性は1/100程度であった.Figure 4. Concentration-dependent inhibition of 26-Dan/RBD interaction by glycyrrhizin and CRL26-1140.おわりに以上より,我々はhACE2 N末端ペプチド模倣体の26番目のアミノ酸にダンシル基を導入することにより,SARS-CoV-2検出用の蛍光性26-Danセンサーを開発した.26-Danセンサーはα-らせん― 30 ―
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